L’actual àmbit biogeogràfic de Flora Catalana comprèn els territoris de la Generalitat de Catalunya (autonomia de l’Estat Espanyol), el de l’estat independent d’Andorra, el de la regió de Perpinyà (Catalunya del Nord, Departament dels Pirineus Orientals, administrativament és un departament de l’Estat Francès) i el de la Franja de Ponent (de l’Alta Ribagorça Occidental al Matarranya, administrativament inclòs dins Aragó, autonomia de l’Estat Espanyol).

Aquests 4 territoris reben el nom genèric de Principat de Catalunya. A la nostra obra de referència, la 3a edició de la Flora Manual dels Països Catalans, de 2005, estan indicats abreujadament com PCat.

Però l'àmbit biogeogràfic de l'associació no sempre ha estat aquest. Flora Catalana va néixer a les Gavarres i progressivament es va anar estenent per les comarques nord-orientals de Catalunya, amb un límit no sempre ben definit, fins assolir l’actual que ara detallem.